东莞位于珠江出海口，虎门历来就是中国南方的重要门户，溯珠江而上，可分别通达粤东、粤北、粤西乃至广西等地。主要港口——虎门港是国家一类口岸，对外国籍船舶开放，每天都有客货轮直达香港，虎门港已建成2000吨级至35000吨级泊位11个，设计能力600万吨，同时，还有莞城港区、石龙港区和中堂、望牛墩、麻涌、新民、洪梅等一批水路进出口货物装卸点。